Руководство
Согласно уставу института, его руководство состоит из директора, заместителя директора по административным вопросам и заместителя директора по развитию. Работой института руководит его директор, трудовой договор с которым заключает, изменяет и расторгает министр юстиции.
В периоды отсутствия директора института его обязанности исполняет назначенный им для этого заместитель. В периоды отсутствия заместителя директора его обязанности или обязанности директора исполняет назначенное директором для этого лицо.
Отделы подчиняются директору через его заместителей. Служба по делам развития и персонала, служба делопроизводства и служба экономика подчиняются непосредственно директору. Служба качества подчиняется заместителю директора по развитию.
Научно-исследовательский совет консультирует руководство по вопросам организации судебных экспертиз, профессиональной подготовки и научного развития в сфере компетенции института.