Juhtimine
Instituudi juhtkonna moodustavad vastavalt põhimäärusele direktor, arenduse asedirektor, teaduse asedirektor, kvaliteedijuht ja personalijuht. Instituudi tööd juhib instituudi direktor, kellega sõlmib, muudab ja lõpetab töölepingu justiits- ja digiminister. Instituudi direktori äraolekul täidab direktori ülesandeid tema määratud asedirektor. Asedirektori äraolekul täidab direktori või asedirektori ülesandeid direktori määratud isik. Osakonnad alluvad direktorile asedirektorite kaudu. Talitused alluvad otse direktorile.
Teadus- ja arendusnõukoda toetab kohtuekspertiisialast teadus- ja arendustegevust instituudis ning vajadusel nõustab juhtkonda ja kolleege.